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愤怒的凤凰》于2016年发布。
4）
1408：52
它是油菜籽，而不是棉花，并且基因组C组装得不好。
问题几乎相同：
1.杂合SNP遵循转录物序列和序列。
我不进行四倍体GWAS分析，因此不敢提出建议，但我将谈谈我的理解。
一到四倍，杂合基因座的错误率可能很高。
这将对后续分析产生重大影响。
例如，取AaBb的四倍体。
杂合基因座可以源自Aa等位基因，其是实际的杂合基因座。
但是，如果A和B非常相似，则SNP在基因A和B之间被调用，并显示为杂合SNP。
但是，由于AB SNP的差异不是等位基因而是同源基因，因此AB SNP的差异实际上是假SNP。
从数据比较的角度来看，前两种情况是完全无法区分的。
但是，A和B在异四倍体中不重组。
因此，AB型异质结必须不符合哈佛平衡。
因此，从理论上讲，可以通过哈佛平衡测试确定该位置是实际的SNP还是同源基因之间的SNP。
所以我的建议是：
（1）删除杂合度超过一定百分比的位点（实际上，这些位点不能通过哈佛平衡测试）
（2）哈尔滨试验，过滤器零件。
其次，参考基因的质量在这里不能修改。
除非重建，否则仅使用重排的数据将无法校正基因组。